MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825623
2	NC_017397	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825623
3	NC_017397	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
4	NC_017397	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825623
5	NC_017397	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825623
6	NC_017397	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825623
7	NC_017397	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825623
8	NC_017397	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825623
9	NC_017397	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825623
10	NC_017397	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825623
11	NC_017397	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825623
12	NC_017397	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
13	NC_017397	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825623
14	NC_017397	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825623
15	NC_017397	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825623
16	NC_017397	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825623
17	NC_017397	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825623
18	NC_017397	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
19	NC_017397	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825623
20	NC_017397	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825623
21	NC_017397	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825623
22	NC_017397	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	387825623
23	NC_017397	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825623
24	NC_017397	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825623
25	NC_017397	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825623
26	NC_017397	AG	4	8	1178	1185	50 %	0 %	50 %	0 %	387825623
27	NC_017397	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825623
28	NC_017397	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825623
29	NC_017397	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825623
30	NC_017397	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825624
31	NC_017397	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825624
32	NC_017397	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825624
33	NC_017397	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825624
34	NC_017397	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	387825624
35	NC_017397	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	387825624
36	NC_017397	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	387825624
37	NC_017397	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	387825624
38	NC_017397	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825624
39	NC_017397	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825624
40	NC_017397	ATAC	2	8	1931	1938	50 %	25 %	0 %	25 %	387825624
41	NC_017397	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825625
42	NC_017397	T	6	6	2144	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	387825625
43	NC_017397	TGG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825625
44	NC_017397	AAC	2	6	2253	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825625
45	NC_017397	TGG	3	9	2277	2285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825625
46	NC_017397	GT	3	6	2302	2307	0 %	50 %	50 %	0 %	387825625
47	NC_017397	AAGA	2	8	2383	2390	75 %	0 %	25 %	0 %	387825625
48	NC_017397	TAAAT	2	10	2418	2427	60 %	40 %	0 %	0 %	387825625
49	NC_017397	CA	3	6	2501	2506	50 %	0 %	0 %	50 %	387825625
50	NC_017397	ATTT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	387825625
51	NC_017397	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387825625
52	NC_017397	TAA	2	6	2569	2574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825625
53	NC_017397	GCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825626
54	NC_017397	GCAA	2	8	2679	2686	50 %	0 %	25 %	25 %	387825626
55	NC_017397	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825626
56	NC_017397	GTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825626
57	NC_017397	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387825626
58	NC_017397	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825626
59	NC_017397	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387825626
60	NC_017397	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387825626
61	NC_017397	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387825626
62	NC_017397	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825626
63	NC_017397	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825626
64	NC_017397	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	387825626
65	NC_017397	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387825626
66	NC_017397	TGG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825626
67	NC_017397	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	387825627
68	NC_017397	AAG	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825627
69	NC_017397	T	6	6	3504	3509	0 %	100 %	0 %	0 %	387825627
70	NC_017397	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825627
71	NC_017397	TGG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825627
72	NC_017397	CTA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825627
73	NC_017397	AAT	2	6	3729	3734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825627
74	NC_017397	TAG	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825627
75	NC_017397	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825627
76	NC_017397	GCAAA	2	10	3870	3879	60 %	0 %	20 %	20 %	387825627
77	NC_017397	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	387825627
78	NC_017397	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825627
79	NC_017397	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
80	NC_017397	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825628
81	NC_017397	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
82	NC_017397	TAT	2	6	4034	4039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
83	NC_017397	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	387825628
84	NC_017397	ACA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825628
85	NC_017397	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
86	NC_017397	TACAA	2	10	4216	4225	60 %	20 %	0 %	20 %	387825628
87	NC_017397	AT	3	6	4274	4279	50 %	50 %	0 %	0 %	387825628
88	NC_017397	TAA	3	9	4289	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825628
89	NC_017397	AGT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825628
90	NC_017397	TTA	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
91	NC_017397	GCT	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825628
92	NC_017397	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825628
93	NC_017397	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825628
94	NC_017397	CGA	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825628
95	NC_017397	GAT	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825628
96	NC_017397	GCA	3	9	4617	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825628
97	NC_017397	GCA	2	6	4632	4637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825628
98	NC_017397	AGT	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825628
99	NC_017397	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825628
100	NC_017397	AGA	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825628
101	NC_017397	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825628
102	NC_017397	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	387825628
103	NC_017397	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	387825628
104	NC_017397	CTA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825628
105	NC_017397	ACAAGC	2	12	4965	4976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387825629
106	NC_017397	GAA	3	9	4984	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825629
107	NC_017397	TTAC	2	8	5152	5159	25 %	50 %	0 %	25 %	387825629
108	NC_017397	GTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825629
109	NC_017397	GAATTT	2	12	5206	5217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825629
110	NC_017397	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	387825629
111	NC_017397	TGAACT	2	12	5244	5255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825629
112	NC_017397	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825629
113	NC_017397	TAG	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825629
114	NC_017397	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825629
115	NC_017397	G	6	6	5298	5303	0 %	0 %	100 %	0 %	387825629
116	NC_017397	TG	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	387825629
117	NC_017397	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	387825629
118	NC_017397	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825630
119	NC_017397	TTC	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825630
120	NC_017397	AG	3	6	5524	5529	50 %	0 %	50 %	0 %	387825630
121	NC_017397	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825630
122	NC_017397	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825631
123	NC_017397	TAG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825631
124	NC_017397	AT	3	6	5917	5922	50 %	50 %	0 %	0 %	387825631
125	NC_017397	AAT	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825631
126	NC_017397	TA	3	6	5933	5938	50 %	50 %	0 %	0 %	387825631
127	NC_017397	CTA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825631
128	NC_017397	AAGT	2	8	6064	6071	50 %	25 %	25 %	0 %	387825631
129	NC_017397	GTA	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825631
130	NC_017397	GCA	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825631
131	NC_017397	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825631
132	NC_017397	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825632
133	NC_017397	CAT	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825632
134	NC_017397	ATC	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825632
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